Odpověď transkriptomu na expozici kadmia u ječmene (Hordeum vulgare L.)
Sledovali jsme trankriptomickou odpověď rostlin ječmene při ovlivnění různými koncentracemi kadmia.
31. srpna 2021
Sledovali jsme trankriptomickou odpověď rostlin ječmene při ovlivnění různými koncentracemi kadmia.
31. srpna 2021
Kadmium je vysoce toxický polutant, který negativně ovlivňuje růst a vývoj rostlin. V předchozích studií byl popsán jeho vliv na nepříznivý vývoj u pšenice a dalších obilovin. V této studii jsme ve spolupráci s kolegy z Ústavu experimentální botaniky v Olomouci provedli analýzu genů a regulačních drah spojených s odpovědí na stres způsobený přítomnosti kadmia u rostlin ječmene (Hordeum vulgaris). Rostliny ječmene byly vystaveny různým koncentracím kadmia. V ovlivněných rostlinách byla nejprve měřena koncentrace kadmia v kořenech a nadzemních částí, po té byl monitorován buněčný cyklus a nakonec byla provedena analýza transkriptomu. Na základě analýzy genové exprese bylo nalezeno několik genů reagujících na přítomnost kadmia. Jeden z nejvíce ovlivněných genů byl gen pro rezistenci ke kadmiu (PLANT CADMIUM RESISTANCE 2 - HvPCR2), který odpovídá za detoxikaci těžkých kovů. Překvapivě byl tento gen nalezen v dalších čtyřech různých kopiích, které vykazovaly specifickou regulaci. Funkčnost všech pěti kopií byla ověřena heterologní expresí v kvasinkách, kde všech pět kopií obnovilo odolnost vůči kadmiu. Jedná se o první studii, která objevila multiplikaci genu PCR2 v rostlinách. Tato studie může poskytnout cenný zdroj pro potenciální využití role genového komplexu HvPCR2 v toleranci kadmia u významných plodin i dalších rostlin.